Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOC4-APOC2K7ER74 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms