Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQV1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQV1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQV1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQV1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQV1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQV1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQV1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQV1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQV1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQV1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQV1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQV1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms