Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E9PCH4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E9PCH4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
E9PCH4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
E9PCH4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
E9PCH4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
E9PCH4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
E9PCH4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
E9PCH4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
E9PCH4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E9PCH4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms