Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BL2E5RIL1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms