Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L13C9JLJ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L13C9JLJ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms