Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATL2C9JE40 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms