Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN25C9JDP6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms