Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMGB1P1B2RPK0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms