Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP27XA6NNY8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP27XA6NNY8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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