Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POTEMA6NI47 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEMA6NI47 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms