Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC160A6NGH7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms