Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GOLGA6L9A6NEM1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms