Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRT87PA6NCN2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRT87PA6NCN2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms