Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms