Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB19A4D1S5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms