Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TOGARAM1-202ENST00000361577 6247 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DAB1-206ENST00000414851 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 XDH-201ENST00000379416 5688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 UGT2B29P-201ENST00000509021 973 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MYO7B-203ENST00000428314 6715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF772-201ENST00000343280 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 EXOC7P1-201ENST00000509881 2059 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HHLA1-202ENST00000434736 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
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