Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 HPS4-201ENST00000336873 3786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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PTPRMP28827 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PTPRMP28827 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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