Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 GPR141-202ENST00000447769 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC008759.2-201ENST00000585880 600 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 MIR6751-201ENST00000610479 63 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA1P17-201ENST00000496620 924 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
IFFO1Q0D2I5 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms