Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PTCH1Q13635 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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PTCH1Q13635 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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