Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ANKS1B-205ENST00000546568 1281 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC114980.1-201ENST00000505668 3157 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NEMP1-202ENST00000379391 5370 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ALPK1-205ENST00000504176 5203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC097717.1-225ENST00000600829 709 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 LMOD1-201ENST00000367288 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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HERC1Q15751 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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