Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C8orf48-201ENST00000297324 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC5G-204ENST00000406962 1562 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 NR1I3-204ENST00000367982 1322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ARF1P1-201ENST00000406466 544 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SYNE1-AS1-201ENST00000412161 553 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AP000474.1-201ENST00000441465 680 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNF185-AS1-201ENST00000526089 353 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R38-201ENST00000547270 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P17-201ENST00000605448 595 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PSG9-205ENST00000443718 1421 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RPL4P3-201ENST00000428881 1311 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SPINK6-201ENST00000325630 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SMIM7-201ENST00000358726 850 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP145-201ENST00000363124 125 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL117338.1-201ENST00000434552 631 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP159-201ENST00000517161 103 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms