Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SMYD1-201ENST00000419482 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 THSD4-203ENST00000357769 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ADAMTS20-204ENST00000553158 4633 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 UGT1A1-202ENST00000360418 3389 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TACC2-208ENST00000369001 3685 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NLRX1-203ENST00000409265 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ABCB4-206ENST00000453593 3699 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF41-201ENST00000313116 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00994-201ENST00000485805 2129 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PDPN-212ENST00000621990 2738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 C6orf222-201ENST00000437635 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CPT1B-201ENST00000312108 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MEF2C-239ENST00000636294 2576 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FGD3-203ENST00000416701 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL023280.1-201ENST00000414840 1423 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ADNP-206ENST00000621696 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IGSF11-208ENST00000489689 3320 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LDB2-202ENST00000441778 2476 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL731563.3-201ENST00000608005 3005 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KBTBD12-204ENST00000407609 4302 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 523.1 ms