Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FHOD3Q2V2M9 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FHOD3Q2V2M9 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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