Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PDK4Q16654 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms