Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC105101.1-201ENST00000623698 2873 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZBTB43-202ENST00000373464 5965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CACNA1S-201ENST00000362061 6166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NBPF15-203ENST00000577412 4707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC1Q15751 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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