Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BIVM-ERCC5R4GMW8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms