Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms