Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX8Q9Y5X2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX8Q9Y5X2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms