Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLF2Q9Y5W3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLF2Q9Y5W3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms