Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C3Q9Y5Q9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms