Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCDHB12Q9Y5F1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms