Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP15Q9Y4E8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP15Q9Y4E8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms