Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRELID3BQ9Y3B1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRELID3BQ9Y3B1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms