Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNIP3Q9Y2W7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms