Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DTX4Q9Y2E6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms