Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRNDQ9UKY0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms