Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBE1Q9UJT0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBE1Q9UJT0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms