Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN11AQ9UI33 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms