Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPC1L1Q9UHC9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPC1L1Q9UHC9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms