Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF1Q9UBU9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF1Q9UBU9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms