Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RRBP1Q9P2E9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RRBP1Q9P2E9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms