Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL20A1Q9P218 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL20A1Q9P218 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms