Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms