Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC59Q9P031 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC59Q9P031 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms