Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms