Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC28Q9NX36 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC28Q9NX36 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms