Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAK1IP1Q9NWT1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAK1IP1Q9NWT1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms