Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L1Q9NU39 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms