Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOMER3Q9NSC5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOMER3Q9NSC5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms