Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT82Q9NSB4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT82Q9NSB4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms